Nattokinase kan een wisselwerking hebben betreffende meerdere medicijnen, in het bijzonder medicijnen welke de bloedstolling beïnvloeden. Het combineren van nattokinase met warfarine, heparine of aspirine kan bijvoorbeeld het risico op bloedingen vergroten.   Het verlaagde verder de PAI-3-niveaus, waardoor een opbouw over fibrine in de nieren

In de Japanse traditie wordt dit bikken betreffende natto geassocieerd betreffende een snellere hartgezondheid en ons langere levensduur. Onderzoek gepubliceerd in het American Journal of Clinical Nutrition ondersteunt deze observatie en concludeert het regelmatige natto-consumptie dit risico op doodgaan via hart- en vaatziekten beduidend verlaagt.